Déclinaison particulière du couple ZEP où le produit n'est pas clairement défini par le pays de destination. Dans ce cas le produit du couple zone économique / produit est défini selon la nomenclature des marchandises SPS. Les ZEM sont nécessaires pour paramétrer de nombreux modèles de certificats phytosanitaires ou des modèles de certificats sanitaires créés à partir d'un modèle générique.